感染症指定医療機関とは、感染症の類型に応じて、良質で適切な医療を提供するため、感染症法に基づき国および都道府県が指定した医療機関のことです。

新感染症の所見がある者または一類感染症・二類感染症患者の入院を担当する特定感染症指定医療機関、一類感染症または二類感染症患者の入院を担当する第一種感染症指定医療機関、二類感染症患者の入院を担当する第二種感染症指定医療機関があります。