特別医療法人とは、公益性があり一定の要件を満たした医療法人ですが、2012年３月をもって廃止されました。

この特別医療法人は特定医療法人にくらべて認可要件が緩く普及することが期待されておりましたが、税制面では一般の医療法人と同じであったために普及が進みませんでした。
また、特別医療法人であった法人は廃止が決定してから、社会医療法人や特定医療法人として申請して認可された医療法人も多数あります。