アンモニアとは、生体内では食物のアミノ酸が腸管内細菌によって分解されたり，尿素が分解されますことで産生されます。

肝臓で尿素に代謝され尿中に排出されます。したがって，肝臓の代謝機能の低下や門脈体循環シャントの形成，腎臓の排出機能の低下のときに血中で高値となります。呼気に特有の尿臭をもたらす。重症肝不全などのときに重症度の指標となりますが，必ずしも常に病態に一致するわけではない。